Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AlyrefO08583 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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