Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec22bO08547 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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