Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm8888J3QPX5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm8888J3QPX5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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