Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc180J3QNE4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc180J3QNE4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms