Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Top6blJ3QMY9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Top6blJ3QMY9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms