Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm3336J3QMQ6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3336J3QMQ6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms