Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930544D05RikJ3QK56 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms