Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
7530416G11RikJ3QJX6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
7530416G11RikJ3QJX6 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms