Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21897J3KMP5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms