Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vmn1r58G3X9U3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vmn1r58G3X9U3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms