Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp32F8VPZ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp32F8VPZ3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms