Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Igkv1-99F6XWB2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms