Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5861F6VCN9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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