Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm340F6RGI3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm340F6RGI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm340F6RGI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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