Protein–RNA interactions for Protein: E9QAB6

Ptar1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptar1E9QAB6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptar1E9QAB6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms