Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms