Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tarbp1E9Q368 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tarbp1E9Q368 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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