Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pdzd2E9Q1M1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdzd2E9Q1M1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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