Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdr1E9Q0B4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdr1E9Q0B4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms