Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3095E9Q058 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3095E9Q058 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms