Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc1E9Q043 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc1E9Q043 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms