Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3002E9PW72 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms