Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ttc17E9PVB5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms