Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cngb1E1AZ71 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cngb1E1AZ71 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms