Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc13D3YV10 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc13D3YV10 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms