Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3259D3YUK0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3259D3YUK0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms