Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Clip3B9EHT4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clip3B9EHT4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clip3B9EHT4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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