Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cspp1B2RX88 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cspp1B2RX88 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms