Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apba1B2RUJ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms