Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ythdc2B2RR83 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ythdc2B2RR83 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms