Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Brpf3B2KF05 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms