Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn34b1B1AZQ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b1B1AZQ8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms