Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms