Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NhsB1AV60 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NhsB1AV60 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NhsB1AV60 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NhsB1AV60 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms