Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Grik3B1AS29 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Grik3B1AS29 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms