Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprsB0V2N1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PtprsB0V2N1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprsB0V2N1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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