Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl41A2AUC9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms