Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Patl2A2ARM1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms