Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CtcflA2APF3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms