Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam43bA2AM80 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms