Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Grin3aA2AIR5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Grin3aA2AIR5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms