Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930447F04RikA2AFR2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms