Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prdm16A2A935 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prdm16A2A935 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms