Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdc27A2A6Q5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdc27A2A6Q5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms