Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A0A0U1RNP2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A0U1RNP2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms