Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4921501E09RikA0A0R4J054 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms