Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trbv30A0A0B4J1P1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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