Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Knop1Q9Z2Q2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Knop1Q9Z2Q2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms