Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn7Q9Z261 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms