Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn8Q9Z260 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms